К сороковым годам XIX столетия в Самаре, которая тогда была провинциальным городом, не было ни одной женской обители. Именно тогда самарцы стали ходатайствовать об учреждении в городе монастыря. В 1850 году было подано прошение епископу Симбирскому Феодотию об открытии в Самаре женской общины. Благополучный ответ на это ходатайство был получен в 1855 году.
В 1860 году общину преобразовали в монастырь со своим уставом, состоявшим из 66 параграфов, который регламентировал порядок богослужений и жизнь инокинь.
Первой в обители была построена часовня во имя Казанской иконы Божией Матери с 8 келиями под ней и вокруг нее. В них поселились 38 подвижниц. Сразу же с декабря 1850 года в часовне началось отправление всенощных бдений и часов причтом Казанского собора, потом — Троицкой церкви.
К 1917 году в обители проживало до 400 насельниц в возрасте от 10 до 100 лет.
После открытия в монастыре появляются всевозможные мастерские: золотошвейная, иконописная, чеканная, белошвейная, ковровая, священнослужительских одежд и облачений, переплетная, башмачная и др. На доходы от этих мастерских и на частные пожертвования жил и развивался монастырь.
В 1919 году монастырь как религиозный институт был закрыт. Возрождение обители началось в 1990-е годы. В 1991 году вновь организованной женской общине было возвращено здание Трапезного храма, а в 1995-м – Иверского.
